Das erste auffallende Manko nach dem Kauf eines MAC MINI 2009 (2 Ghz Core 2 Duo) ist der stumme Audioeingang (Line-In) bei Audiosignalen ohne Vorverstärker. Aus eigener Erfahrung kann der MAC MINI kein Signal eines direkt angeschlossenen Airport Express oder iPods über ein Stereo Klinke Kabel in ein Tonsignal über den Audioausgang (Line-Out) ausgeben (obwohl ein ausschlagender Pegel in den Einstellungen erkennbar ist kommt kein Ton aus der Keksdose). Technisch gesehen kann der MAC MINI von Haus nur entweder einen Ton wiedergeben oder einen aufnehmen. Beides in Kombination ist warum auch immer nicht im Standard vorgesehen.
Abhilfe für dieses Problem bei der Nutzung des MAC MINI als Mediacenter bietet die kostenlose Software von Rogue Amoeba "LineIn" bevor man sich unnötig eine externe Soundkarte mit den notwendigen Anschlüssen für den USB Port kauft.
LineIn ist eine simple Anwendung für MAC OS X, die einen software basierten "PlayThru" eines Audiosignals über den Audioeingang an den Audioausgang des MAC MINI ermöglicht (Also kein Entweder oder mehr). In kurzen Worten kann man den Audioeingang (Line-In) dafür benutzen ein Mikrophon oder anderes Gerät ohne Vorverstärker über das MAC MINI eigene Mainboard wiederzugeben wie es mit der Option " Play input through output device" unter OS 9 möglich gewesen ist.